Наукова діяльність НАНЦ спрямована на виконання завдань та заходів Державної цільової науково-технічної програми проведення досліджень в Антарктиці на 2011-2023 роки.

Ця програма передбачає комплексні фундаментальні та прикладні дослідження в Антарктиді за основними сучасними науковими напрямами, що охоплюють науки про життя, науки про Землю та фізичні науки, відповідно до рекомендацій Наукового комітету з антарктичних досліджень (SCAR).

Зокрема, центр забезпечує:

• проведення постійних моніторингових спостережень та оригінальних досліджень на станції “Академік Вернадський” та виконання міжнародних зобов’язань щодо передачі даних (геомагнітні, озонометричні, метеорологічні та ін.) міжнародним центрам та організаціям;
• проведення сезонних досліджень в районі станції “Академік Вернадський” з розширенням робіт на західну частину Антарктичного півострова;
• проведення наукових досліджень у провідних лабораторіях університетів та академічних установ України в межах науково-технічних проєктів з використанням первинних даних, зразків та матеріалів, отриманих під час експедиційних досліджень в Антарктиці.